Nel 1155 Enrico II di Babenberg affidò l'abbazia ai monaci scozzesi. Nel 1418, per ordine del duca, furono accolti nel monastero di Mellicense dei monaci provenienti da quel luogo, mentre gli scozzesi tornarono a Ratisbona, da dove erano stati originariamente chiamati. In quel periodo il monastero continuava a esistere senza essere stato soppresso.